Programa

El VI Taller de Genética para la Conservación: procesos microevolutivos en especies silvestres, auspiciado por la Red Latinoamericana de Genética para la Conservación, ReGeneC, es un curso Latinoamericano a nivel de post-grado, orientado a dar una visión integral de los diferentes aspectos de la genética aplicada a la conservación. En consecuencia, no se trata de un curso de ecología molecular sino de un recorrido global de los distintos abordajes a considerar cuando se integran aspectos moleculares, evolutivos y los problemas de conservación. El curso está dirigido a estudiantes de post-grado o profesionales que se encuentran en la etapa de diseño o en la fase inicial de ejecución de su tesis o proyecto, tal que pudiera serles de utilidad para mejorarle. El curso facilita, además de la formación teórica y práctica en esta área de la biología de la conservación, el intercambio de experiencias con quienes trabajan directamente con las especies silvestres presentes en América Latina.

El curso involucra diferentes actividades, entre ellas: clases magistrales, sesiones teóricas, sesiones prácticas de análisis de datos en salas de computación, foros de presentación de casos y discusión, sesiones de discusiones sobre los tópicos cubiertos, presentación y defensa de los proyectos de investigación a ser desarrollados por los alumnos. El contenido programático del curso, en general, está organizado de la siguiente manera:

Unidades
 Temas y Responsables
I. Introducción
- Objetivos (u objetos) de la conservación hasta el presente. Este curso en contexto.
- La genética para la conservación: repaso histórico, tipo de preguntas/problemas que ayuda a responder/solucionar, conservación como proceso.
- ¿Por qué conservar?
Responsables: A. Martino, K. Rodríguez-Clark, M. Aguilera, M.A. Oliveira-Miranda, A. Solé-Cava
II. Conceptos básicos: 1.- Diseño de proyectos y obtención de muestras
- Estructura de proyectos.
- Planteamiento de hipótesis.
- Obtención y almacenamiento de muestras. Muestreos invasivos y no invasivos.
Responsables: C. Miyaki, M.A. Oliveira-Miranda, M. Méndez, F. Pérez, K. Rodríguez-Clark
II. Conceptos básicos: 2.- Estadísticas
- Generación de modelos y usos generales en diseño de proyectos/específicos en análisis genéticos: Hipótesis nulas en términos estadísticos, Relación entre mecánica general de estadística clásica con máxima verosimilitud (ML), estadística Bayesiana, remuestreo/Montecarlo
-Métodos de Montecarlo
- Cadenas de Markov
-Contraste de estimación Bayesiana versus máxima verosimilitud: Ley de Bayes (Caso discreto vs caso continuo), Probabilidad vs densidad)
Responsables: K. Rodríguez-Clark, M. Méndez
II. Conceptos básicos: 3.- Marcadores y análisis de secuencias
- Marcadores moleculares y citogenéticos empleados en estudios de GC: tipos de marcadores según las preguntas a contestar. Marco general, ejemplos específicos con plantas, hongos, animales
- Alineamiento y calidad de secuencias (repaso teórico-práctico)
Responsables: : E. Poulin, F. Pérez, M. Méndez
III. Filogenia
- ¿Qué es filogenia?, Aplicaciones a la conservación
- Métodos filogenéticos: Parsimonia y métodos de distancia
- Métodos filogenéticos: Likelihood
- Métodos filogenéticos: Inferencia bayesiana
- Sesión práctica
Responsables: C. Miyaki, M. Méndez
IV. Demografía y Filogeografía
- Modelo de Wright-Fisher
- La coalescencia
- Inferencia demográfica
- Filogeografía (introducción)
- Sesión práctica - Estudio de casos: Trachurus murphyi (jurel), (DNAsp, Network)
- Orestias ascotanensis (pez en salar del altiplano) (Arlequín, SAMOVA)
Responsable: E. Poulin
V. Deriva génica, tamaño poblacional efectivo y fragmentación
- Deriva génica y tamaño poblacional efectivo (Ne): teoría, ejemplos, práctica MLNe y Lane.
- Fragmentación poblacional: FST - Equilibrio - limitaciones, práctica Genepop.
- Fragmentación poblacional: Relajamiento de condiciones, no equilibrio (Métodos basados en modelos de agrupamiento, Ancestro individual, Asignamiento a poblaciones, Cuellos de botella), práctica Structure.
- Genética espacial.
- Divergencia poblacional adaptativa: Cociente QST/FST, controversia, limitaciones del método, desarrollo reciente.
Responsable: D. Ruzzante
VI. Parentesco, paternidad y endogamia
- ¿Qué es genotipificar, cómo se hace y algunas aplicaciones en conservación?. Aplicaciones genotipificar: ecología del comportamiento y conservación. Sesión práctica1: Caso báquiros, cómo los análisis de parentesco pueden complementar datos de observaciones de comportamiento entre individuos (MLRelate). Sesión práctica 2: uso del programa Pedigree con un caso de peces
- Definición e importancia de endogamia y parentesco, cómo calcular cuando ya se saben las relaciones familiares. Aplicación a definición de metas de recuperación ("regla" 50/500/5000). Aplicación en poblaciones manejadas intensivamente: la variedad de metas para dichas poblaciones, problemas genéticos frecuentes (depresión endogámica, domesticación, pérdida de adaptabilidad) y manejo genético consecuente. Cálculo de parentesco y endogamia en población real. Priorización de acciones de manejo según resultados. Sesión práctica
Responsables: C. Miyaki, D. Ruzzante, K. Rodríguez-Clark
VII. Comportamiento y procesos microevolutivos
- Comportamiento animal, conservación y procesos microevolutivos: variabilidad intra-específica, selección sexual, sistemas de apareamiento y uso del espacio.
Responsable: R. Vásquez
VIII. Aplicaciones de la genética en la conservación
- ¿Cómo la identificación de especies (incluyendo barcoding) y de linajes se transforma en un tema de conservación? I. Especies crípticas y II. Uso y tráfico ilegal de especies?.
- Bioinvasiones: Cómo una especie llega a ser invasora y consecuencia para especies locales.
- Bioinvasiones.
Responsables: C. Miyaki, M. Aguilera, D. Ruzzante.
IX. Conservación y sociedad
- Bioética y conservación de la diversidad genética.
- Aspectos legales vinculados a la conservación de la diversidad genética. relación con Biopiratería.
- Caso tigre de Tasmania: ciencia o bioética
Responsables: M. Aguilera, A. Martino, M.A. Oliveira-Miranda, K. Rodríguez-Clark
X. Discusión y presentaciones de los estudiantes

Responsables:Todos los profesores y alumnos