Programa

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El curso tiene nivel de postgrado. Todos sus profesores tienen nivel de Doctorado o PhD. El programa del curso ha sido organizado en clases teóricas magistrales, clases teórico-prácticas, sesiones participativas o talleres, mesas de discusión, análisis en grupo de estudios de casos, así como sesiones de discusión individualizadas con el comité asesor designado para profundizar en los diferentes aspectos de los proyectos de investigación presentados por cada estudiante. El curso cuenta con evaluaciones continuas y cierra con la presentación y defensa por parte de cada estudiante de su proyecto. El contenido programático ha sido organizado de la siguiente manera:

Unidad I. La conservación genética en contexto

  • ¿Por qué conservar?
  • La genética para la conservación: repaso histórico
  • Marco conceptual: La conservación como proceso

Unidad II. Conceptos básicos

1. Diseño de proyectos

  • Estructura de proyectos
  • Planteamiento de hipótesis

2. Manejo de las muestras

  • Recolección y almacenamiento de muestras
  • Muestreos invasivo y no invasivo. Diseño de muestreo
  • Discusión por equipos de los métodos utilizados por los participantes

3. Marcadores moleculares

  • Marcadores moleculares y “Next Generation Sequencing”. Ejemplos aplicados a Genética para la Conservación
  • Usos Potenciales de las NGS para resolver problemas de genética para la conservación
  • Alineamiento y calidad de secuencias (repaso teórico-práctico)

Unidad III. Filogenia

  • ¿Qué es filogenia?
  • Métodos filogenéticos: Parsimonia y métodos de distancia, “Likelihood” e Inferencia Bayesiana
  • Generación de modelos: Estadística clásica con máxima verosimilitud (ML), Remuestreo / Montecarlo
  • Métodos de Montecarlo
  • Cadenas de Markov
  • Inferencia Bayesiana. Contraste de estimación Bayesiana vs. máxima verosimilitud. Ley de Bayes: Caso discreto vs. caso continuo. Probabilidad vs densidad. Sesión práctica
  • Especies crípticas

Unidad IV. Demografía y Filogeografía

  • Modelos determinísticos y estocásticos. El modelo de Wright-Fisher
  • Filogeografía
  • La coalescencia
  • Inferencia demográfica y estructuración
  • Sesión práctica con casos de estudio de especies latinoamericanas (utilizando DNAsp, Network y Lamarc)

Unidad V. Deriva génica y tamaño poblacional efectivo

  • Deriva génica y tamaño poblacional efectivo (Ne). Sesión práctica: MLNe y LDNe
  • Fragmentación poblacional: FST – Equilibrio – limitaciones
  • Fragmentación poblacional: Relajamiento de condiciones, no equilibrio
  • Sesión práctica con Caso de estudio: manejo pesquero (Structure, Arlequin, Genetix, Geneclass)
  • Efectos y manejo de la fragmentación del hábitat

Unidad VI. Parentesco, paternidad y endogamia

  • ¿Qué es genotipificar, cómo se hace y algunas aplicaciones en conservación?
  • Aplicaciones genotipificar: ecología del comportamiento y conservación
  • Definición e importancia de parentesco, cómo calcular cuando ya se saben las relaciones familiares
  • Cálculo de parentesco en población real. Priorización de acciones de manejo según resultados
  • Análisis de parentesco: Aplicaciones a la conservación
  • Sesión práctica: Relaciones de parentesco (MLRelate)

Unidad VII. Aplicaciones

  • Aplicaciones de genética a problemas de conservación
  • Listas Rojas de especies y la genética para la conservación
  • Análisis forense aplicado a la genética de la conservación

Unidad VIII. Conservación y sociedad

  • Legal: ¿cuál es el marco jurídico que sustenta los estudios con diversidad genética?. ¿Está orientado a los elementos de la diversidad o a recursos?
  • Implicaciones éticas de la investigación en GC. Resolución de casos
  • Especies invasoras

Unidad IX. Discusión de proyectos y presentaciones de los estudiantes

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