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Programa del XIII Taller

Preservando el Futuro

Unidad I. Introducción a la Genética para la Conservación

  • ¿Por qué conservar?
  • Genética para la Conservación (GC): Reseña histórica
  • La conservación como un proceso: Ejes genéticos y de conservación en el marco de proyectos CG. Genética para la conservación en América Latina

Unidad II. Conceptos básicos

  • Estructura de proyectos (definiendo problema, hipótesis, objetivos y metodología)
  • ¿Dónde está la conservación en tu Proyecto?
  • Diseño experimental
  • Marcadores moleculares y “Next Generation Sequencing”
  • Muestras: colección invasiva y no invasiva de muestras y almacenamiento
  • Ecología evolutiva detrás de proyectos en genética para la conservación
  • GIS y modelaje de nicho ecológico como herramientas de apoyo
  • Protocolos computacionales para analizar grandes volúmenes de datos genómicos

Unidad III. Filogenia

  • Alineamiento y calidad de secuencias (sesión teórica y práctica)
  • Métodos filogenéticos
    1. Parsimonia y métodos de distancia
    2. Verosimilitud
    3. Inferencia bayesiana.
  • Selección de modelos
  • Estadística clásica con máxima verosimilitud (ML)
  • Remuestreo
  • Métodos Montecarlo
  • Cadenas de Markov
  • Inferencia bayesiana vs. Máxima Verosimilitud
    • Teorema de Bayes
    • Caso Discreto vs. Caso Continuo
    • Probabilidad y Densidad
  • Sesiones prácticas

Unidad IV. Demografía y Filogeografía

  • Modelos estocásticos y determinísticos
  • Modelo de Wright-Fisher
  • Filogeografía
  • Especies crípticas
  • Coalescencia
  • Inferencia demográfica
  • Sesiones prácticas y estudio de casos.

Unidad V. Deriva génica y Tamaño Poblacional Efectivo (Ne)

  • Deriva génica y Tamaño poblacional efectivo (Ne) (Sesiones teóricas y prácticas)
  • Fragmentación poblacional: FST (condiciones de equilibrio, limitaciones)
  • Fragmentación poblacional: Condiciones de no equilibrio (sesión teórica y práctica)
  • Caso de estudio: Manejo de pesquerías (Structure, Arlequin, Genetix, Geneclass)
  • Genética del paisaje, efectos de la fragmentación, explotación y adaptación al cautiverio

Unidad VI. Parentesco, paternidad y endogamia

  • Genotipificar: qué es, cómo se hace y algunas aplicaciones en ecología del comportamiento y conservación
  • Parentesco: definición e importancia
  • Cálculo de parentesco en poblaciones naturales y priorización de acciones según resultados
  • Análisis de parentesco y aplicaciones en conservación. Sesión práctica

Unidad VII. Genética para la Conservación y el paradigma adaptativo

  • ¿Cómo identificar adaptaciones hipotéticas en poblaciones naturales?
  • Genómica poblacional
  • Análisis demográficos e identificación de regiones genómicas bajo selección, aplicaciones en conservación y estrategias
  • Generación de próxima generación en la conservación y manejo de especies silvestres. Sesiones prácticas

Unidad VIII. Aplicaciones de Genética para la Conservación

  • Empleando genética para la conservación en programas y estrategias de manejo
  • Análisis forenses
  • Estudio de Bioinvasiones: ¿cómo una especie se vuelve invasora bajo la visión de la genética de poblaciones. Estudio de casos: Aplicando herramientas de genética para la conservación en casos reales

Unidad IX. Conservación y Sociedad

  • Legal: Marco jurídico para los estudios con diversidad genética. ¿Diversidad biológica o recursos?
  • Ética Biocultural y conservación de la diversidad genética
  • ¿Ciencia ingenua, desarrollo técnico o problemas éticos?

Unidad X. Discusión y presentación de proyectos de los estudiantes

  • Profesores y estudiantes se reúnen, presencialmente o en forma virtual, para discutir sus respectivos proyectos. Cada estudiante tiene asignado un comité asesor, conformado por tres o cuatro profesores, con los cuales debe reunirse. Adicionalmente, es deseable que discuta con todos los profesores sobre temas específicos de interés para su proyecto. Posteriormente, el estudiante realiza la presentación y defensa pública de sus trabajos

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