Unidad I. Introducción a la Genética para la Conservación
- ¿Por qué conservar?
- Genética para la Conservación (GC): Reseña histórica
- La conservación como un proceso: Ejes genéticos y de conservación en el marco de proyectos CG. Genética para la conservación en América Latina
Unidad II. Conceptos básicos
- Estructura de proyectos (definiendo problema, hipótesis, objetivos y metodología)
- ¿Dónde está la conservación en tu Proyecto?
- Diseño experimental
- Marcadores moleculares y “Next Generation Sequencing”
- Muestras: colección invasiva y no invasiva de muestras y almacenamiento
- Ecología evolutiva detrás de proyectos en genética para la conservación
- GIS y modelaje de nicho ecológico como herramientas de apoyo
- Protocolos computacionales para analizar grandes volúmenes de datos genómicos
Unidad III. Filogenia
- Alineamiento y calidad de secuencias (sesión teórica y práctica)
- Métodos filogenéticos
- Parsimonia y métodos de distancia
- Verosimilitud
- Inferencia bayesiana.
- Selección de modelos
- Estadística clásica con máxima verosimilitud (ML)
- Remuestreo
- Métodos Montecarlo
- Cadenas de Markov
- Inferencia bayesiana vs. Máxima Verosimilitud
- Teorema de Bayes
- Caso Discreto vs. Caso Continuo
- Probabilidad y Densidad
- Sesiones prácticas
Unidad IV. Demografía y Filogeografía
- Modelos estocásticos y determinísticos
- Modelo de Wright-Fisher
- Filogeografía
- Especies crípticas
- Coalescencia
- Inferencia demográfica
- Sesiones prácticas y estudio de casos.
Unidad V. Deriva génica y Tamaño Poblacional Efectivo (Ne)
- Deriva génica y Tamaño poblacional efectivo (Ne) (Sesiones teóricas y prácticas)
- Fragmentación poblacional: FST (condiciones de equilibrio, limitaciones)
- Fragmentación poblacional: Condiciones de no equilibrio (sesión teórica y práctica)
- Caso de estudio: Manejo de pesquerías (Structure, Arlequin, Genetix, Geneclass)
- Genética del paisaje, efectos de la fragmentación, explotación y adaptación al cautiverio
Unidad VI. Parentesco, paternidad y endogamia
- Genotipificar: qué es, cómo se hace y algunas aplicaciones en ecología del comportamiento y conservación
- Parentesco: definición e importancia
- Cálculo de parentesco en poblaciones naturales y priorización de acciones según resultados
- Análisis de parentesco y aplicaciones en conservación. Sesión práctica
Unidad VII. Genética para la Conservación y el paradigma adaptativo
- ¿Cómo identificar adaptaciones hipotéticas en poblaciones naturales?
- Genómica poblacional
- Análisis demográficos e identificación de regiones genómicas bajo selección, aplicaciones en conservación y estrategias
- Generación de próxima generación en la conservación y manejo de especies silvestres. Sesiones prácticas
Unidad VIII. Aplicaciones de Genética para la Conservación
- Empleando genética para la conservación en programas y estrategias de manejo
- Análisis forenses
- Estudio de Bioinvasiones: ¿cómo una especie se vuelve invasora bajo la visión de la genética de poblaciones. Estudio de casos: Aplicando herramientas de genética para la conservación en casos reales
Unidad IX. Conservación y Sociedad
- Legal: Marco jurídico para los estudios con diversidad genética. ¿Diversidad biológica o recursos?
- Ética Biocultural y conservación de la diversidad genética
- ¿Ciencia ingenua, desarrollo técnico o problemas éticos?
Unidad X. Discusión y presentación de proyectos de los estudiantes
- Profesores y estudiantes se reúnen, presencialmente o en forma virtual, para discutir sus respectivos proyectos. Cada estudiante tiene asignado un comité asesor, conformado por tres o cuatro profesores, con los cuales debe reunirse. Adicionalmente, es deseable que discuta con todos los profesores sobre temas específicos de interés para su proyecto. Posteriormente, el estudiante realiza la presentación y defensa pública de sus trabajos
