-
UNIDAD I. Biología y Genética para la conservación en contexto- La genética para la conservación: repaso histórico. - La Conservación como un proceso: Marco conceptual. Discusión sobre el tipo de preguntas adaptadas a proyectos de genética para la conservación - ¿Por qué Conservar?
-
UNIDAD II. Conceptos básicos: 1.- Diseño de proyectos, obtención de muestras y marcadores moleculares- Estructura de proyectos. Importancia del diseño experimental. - Formulación de hipótesis. - Diseño experimental: obtención y almacenamiento de muestras. Muestreo invasivo y no invasivo. - Marcadores moleculares y “Next Generation Sequencing”
-
UNIDAD II. Conceptos básicos: 2.- Estadísticas- Modelos determinísticos y modelos estocásticos
-
UNIDAD II. Conceptos básicos: 3.- Análisis de secuencias- Alineamiento y calidad de secuencias (sesión teórica-práctica)
-
UNIDAD III. Filogenia- ¿Qué es filogenia? - Aproximaciones y métodos: a) Parsimonia y métodos de distancia, b) Método de verosimilitud o “Likelihood”, y c) Inferencia Bayesiana. - - Selección del modelo: estadística clásica con máxima verosimilitud (ML), remuestreo / Montecarlo - Métodos de Montecarlo - Cadenas de Markov - Inferencia Bayesiana vs. Máxima verosimilitud - Teorema de Bayes: Caso discreto vs. Caso contínuo - Probabilidad y Densidad - Sesión práctica.
-
UNIDAD IV. Filogeografía y Demografía molecular- Especies críptica - Filogeografía: Conceptos básicos. Ventajas y limitaciones de diferentes aproximaciones. - Modelo de Wright-Fisher - Modelo de Coalescencia - Inferencia demográfica.
-
UNIDAD V. Deriva génica y Tamaño Poblacional Efectivo- La Deriva génica y el Tamaño poblaciones efectivo (Ne). - Fragmentación Poblacional: FST – Condiciones de Equilibrio – Limitaciones - Fragmentación Poblaciones: Condiciones de no equilibrio - Genética del Paisaje (Landscape genetics)
-
UNIDAD VI. Parentesco, paternidad y endogamia- Genotipificación y algunas aplicaciones en Ecología del comportamiento y Conservación - Análisis de Parentesco: Cálculo del parentesco en poblaciones naturales. Priorización de acciones de manejo basadas en los resultados de parentesco. Aplicaciones en la Conservación.
-
UNIDAD VII. Aplicaciones en Genética para la Conservación- El uso de la Genética para la Conservación en los programas y estrategias de gestión y manejo. Casos de estudio. - Bioinvasiones: ¿Cómo una especie se vuelve invasiva desde el punto de vista de la genética de poblaciones? Posibles estrategias de gestión y manejo. Invasiones causadas por humanos. - Análisis forense aplicado a la genética de la conservación. Casos de estudio.
-
UNIDAD VIII. Conservación y Sociedad- ¿Por qué conservar? Aspectos filosóficos. - Bioética y conservación de la diversidad genética. - Aspectos legales relacionados con la conservación de diversidad genética en América Latina. Marco legal existente. Problemas de biopiratería.
-
UNIDAD IX. Genética para la Conservación de cara al futuro- ¿Cómo identificar adaptaciones hipotéticas en poblaciones naturales? - Aplicaciones potenciales de las tecnología de Secuenciación de Próxima Generación (NGS) para resolver problemas de conservación genética
-
UNIDAD X. Integración y Aplicación de aspectos teóricos y prácticos en los proyectos sobre Genética para la Conservación presentados por los estudiantes- Revisión de los proyectos de los estudiantes. Análisis de contexto y de estructura. Tipo de pregunta abordada. Etapa en el proceso de conservación en la que se encuentra el proyecto. Nivel de organización considerado. Claridad en los conceptos utilizados. Diseño experimental. Aplicabilidad en conservación en el corto, mediano o largo plazo. Para alcanzar este objetivo del curso, se realizarán reuniones individuales entre los estudiantes y revisores asignados. Adicionalmente cada estudiante presentará su Proyecto a todo el equipo de profesores y demás estudiantes asistentes al curso.